Народився 3 лютого 1959 р. у м. Харкові.У 1981 р. закінчив Харківський зооветеринарний інститут за фахом «ветеринарний лікар». У 1981—1983 рр. працював старшим ветеринар­ним лікарем в Українському науково-дослідному інституті експери­ментальної ветеринарії (УНДІЕВ) (нині - ННЦ «ІЕКВМ»). У 1984— 1987 рр. навчався в аспірантурі при вищезазначеному інституті за спеці­альністю ветеринарна мікробіологія, вірусологія, епізоотологія, міколо­гія та імунологія. У 1988—1990 рр. — молодший науковий співробітник, у 1990—1994 рр. — старший науковий співробітник, у 1994—1999 рр. — завідувач лабораторії хвороб бджіл, у 1999—2001 рр. — заступник директора з питань науки, економіки та впровадження; у 2001—2003 рр. — завідувач лабораторії хвороб бджіл ІЕКВМ УААН. З 2003 р. і донині обіймає по­саду директора Інституту тваринництва НААН.У 1988 р. в Білоруському науково-дослідному інституті експериментальної ветеринарії ім. С. Н. Вишелеського захистив кандидатську дис­ертацію на тему: «Американський гнилець бджіл та його вакцинопрофілактика», у 2004 р. в Інституті експериментальної і клінічної ветеринар­ної медицини УААН — докторську дисертацію на тему: «Змішані заразні хвороби розплоду медоносних бджіл (епізоотологія, диференційна діа­гностика, комплексна система заходів боротьби та профілактики)».Доктор ветеринарних наук з 2004 р.Учене звання професора присвоєно у 2010 р.За період наукової діяльності став визнаним спеціалістом у галузі вивчення інфекційних і паразитарних хвороб бджіл, розробки фармакологічних препаратів та засобів дезінфекції для їхньої профілактики і лікуван­ня. За роки наукової діяльності під керівництвом ученого та з його безпо­середньою участю підготовлено низку наукових розробок, які затвердже­но Державним департаментом ветеринарної медицини та впроваджено у ветеринарну практику. Вперше з колективом учених розробив біологіч­ний препарат — вакцину для профілактики і лікування американського гнильця бджіл, зробив вагомий внесок у вивчення основ резистентності й імунітету у бджіл, зокрема було визначено фактори гуморального іму­нітету бджіл. Є членом секції фармакологічних ветеринарних препаратів Державної фармакологічної комісії ветеринарної медицини.Є. В. Руденко є науковим керівником програм «Технології виробництва продукції тваринництва на інноваційній основі», «Розробка та наукове обґрунтування і практична оцінка норм, технологій виробництва кормів і годівлі тварин», «Система організаційно-економічних, технологічних та селекційних рішень з ефективного виробництва про­дукції молочного і м'ясного скотарства», та підпрограми «Інноваційні технології конкурентоспроможного органічного виробництва продук­ції тваринництва».В останні роки вчений опікується проблемою якості кормів і розробкою системи регулювання їхньої якості та безпеки. Є експертом Між­народного епізоотичного бюро з питань заразних хвороб бджіл, членом робочої групи міжнародної організації АПІМОНДІЯ з питань якості продуктів бджільництва, головою вченої ради та головою спеціалізованої вченої ради із захисту докторських і кандидатських дисертацій при Інсти­туті тваринництва НААН, головою Технічного комітету (ТК) зі стандар­тизації № 158 Держспоживстандарту України, членом науково-технічної ради з питань виробництва і переробки продукції тваринництва та пта­хівництва, керівником випробувального центру «Відділ екологічного мо­ніторингу та якості продукції тваринного походження ІТ НААН» та ке­рівником базової організації метрологічної служби МінАПК, головним редактором Науково-технічного бюлетеня ІТ НААН.Вченим опубліковано 145 наукових праць, у тому числі 7 моногра­фій, 1 довідник, 1 навчальний посібник. Має 1 авторське свідоцтво та 6 патентів. Підготував 4 кандидатів наук.Обрано у 2007 р. членом-кореспондентом УААН Відділення ветеринарної медицини зі спеціальності ветеринарна медицина.У 1998 р. присвоєно почесне звання заслуженого працівника сільського господарства України. У 2009 р. нагороджений Почесною відзна­кою УААН та знаком Пошани Міністерства аграрної політики України.